| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1402 | ヤマグチ ハヤテ 山口 颯爽 (3) | 土井首 | 4:32.01 | |
| 2 | 3409 | ナガオカ ハルミチ 長岡 春道 (3) | 琴海 | 4:34.42 | |
| 3 | 3507 | ヤマモト シュウイチロウ 山本秀一郎 (3) | 長崎大附属 | 4:37.65 | |
| 4 | 3510 | ヒエハタ フミアキ 稗圃 史晃 (3) | 長崎大附属 | 4:38.28 | |
| 5 | 106 | シロタニ ダイナ 城谷 大凪 (3) | 東長崎 | 4:38.62 | |
| 6 | 105 | ナカザト イッキ 中里 一気 (3) | 東長崎 | 4:47.16 | |
| 7 | 3202 | ヤマシタ リョウジ 山下 凌史 (3) | 小ヶ倉 | 4:52.14 | |
| 8 | 1701 | アリムラ ジン 有村 仁 (3) | 福田 | 4:52.94 | |
| 9 | 3402 | ナガタ リク 永田 陸 (3) | 琴海 | 5:05.95 | |
| 10 | 1413 | ヤマサキ ヨシト 山﨑 慶人 (3) | 土井首 | 5:19.64 |