| 順位 | No. | 氏名 | 所属 | 記録 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2278 | クリハラ コウヨウ 栗原 光陽 | 長崎市陸協 | 4:09.00 | |
| 2 | 420 | マルヤマ カンセイ 丸山 寛生 (3) | 長崎南山 | 4:18.39 | |
| 3 | 2281 | ワシオ ユウイチ 鷲尾 優一 | 長崎市陸協 | 4:19.24 | |
| 4 | 2172 | タシロ ミズキ 田代 瑞貴 (3) | 長崎大 | 4:29.49 | |
| 5 | 223 | サカモト ケイタ 坂本 啓太 (3) | 海星 | 4:36.69 | |
| 6 | 217 | シノザキ ユウシン 篠崎 勇伸 (1) | 海星 | 4:43.06 | |
| 7 | 2252 | カワハラ ヒロアキ 川原 大明 | 三菱重工RC | 5:02.41 | |
| 8 | 2205 | ソノダ シゲユキ 園田 繁之 (3) | 長大医学部 | 5:05.98 |